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    经济快捷的SNP位点研究方法-SNP基因分型

    发布时间: 2021-10-11  点击次数: 222次

    SNP,全称 Single Nucleotide Polymorphisms,是指在基因组上单个核苷酸的变异。目前很多人仍然使用测序法来进行研究,具有准确、直观的优点。但有一种方法,能间接的研究SNP,且经济快捷,那就是——SNP基因分型。


    其实现原理:熔解温度(melting temperature,Tm)是指吸光值增加到最大值的一半时的温度称为DNA的解链温度或熔点。当实时荧光定量PCR中的荧光探针与靶基因错配,即靶基因序列上产生了核苷酸变异,他们的熔解温度比较低。相对而言,没有突变的靶基因与探针杂交的熔解温度较高。通过区分熔解温度的差异,来区分突变型和未突变型(野生型)。


    进行SNP基因分型需要注意:

    1、将突变的位点放在探针中间。

    2、保证两条探针的熔解温度相同。


    荧光探针中,Taqman探针可进行SNP基因分型。推荐Applied Biosystems公司的Taqman MGB探针,相对普通Taqman探针,与错配序列的熔解温度相差更大。


    分子信标也可用于SNP基因分型。他的茎环结构比一般线性的分子探针更适合SNP分型,茎环结构与错配序列杂交的热稳定性更低,熔解温度相差也更大。


    读者们可根据自己的实验需求,选择合适的方法进行分析。


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